■招待講演など(2009~2012)
- 藤崎弘士，生体分子のパスサーチ・パスサンプリング，佐々研セミナー（東大），2012.5.15 講師．
- 藤崎弘士，「生体分子におけるパスサーチ・パスサンプリング」日本物理学会 春季大会、2012年3月
- 藤崎弘士，“Path sampling based on path integral: Quantum string method and Onsager-Machlup action functional approach”, 2012.3.7 統計数理研究所，高次元のサンプリングとデータ解析からみたシミュレーション科学，講師．
- 藤崎弘士，「生体分子におけるパスサーチ・パスサンプリング」2011.11.25 東京大学先端科学技術研究センター，CMSI 若手技術交流会（第３回）、講師．
- 藤崎弘士，「タンパク質科学の未来を語る：実験・理論研究者の対話」2011.11.21-22 大阪大学蛋白質研究所セミナー，パネリスト．
- 藤崎弘士，「ハイ・パフォーマンス・コンピューティング(HPC)を使った生体分子のシミュレーション：その現状と課題」2011.9.23 日本物理学会 秋季大会、領域12 シンポジウム世話人.
- Hiroshi Fujisaki, “Quantum dynamics in complex systems: Biomolecules, random matrix, and quantum chaotic systems”, 2011.7.5 Freiburg Institute for Advanced Studies (FRIAS), Oral presentation.
■国際会議(2009~2012)
- H. Fujisaki, Theoretical investigation of vibrational energy transfer using the tier model with ab initio potential energy surfaces, Gordon Research Conference on vibrational spectroscopy, Biddeford, Maine (USA), Aug. 2012.
- H. Fujisaki, M. Shiga, and A. Kidera, A multiscale approach for path sampling: Application to peptides, 56th Annual Meeting of Biophysical Society, San Diego (USA), Oral presentation, Feb. 26, 2012.
- H. Kikuchi, H. Fujisaki, T. Furuta, K. Okamoto, S. Leimkuhler, and T. Nishino, Structure-based inhibitor mechanism of febuxostat for xanthine oxidoreductase: molecular dynamics study, 9th Triennial Congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemists, Santiago de Compostela (Spain), July 2011.
- 2011/7/19 WATOC2011 (Santiago de Compostela)
A study of the phase transition temperature and bilayer structure change of phospholipid by MD method
Toshihiko Ogihara, Qi Gao, Akiyoshi Shibata, Hiroshi Kagawa
- H. Fujisaki, M. Shiga, and A. Kidera, A multi-scale approach for path sampling, 55th Annual Meeting of Biophysical Society, Baltimore (USA), Mar. 2011．
- 2010/09/27 International Conference on Bioinformatics (InCoB2010) (Tokyo)
Structure Deviation Analysis of Proteins Complexed with Various ATP Analogs
Hiroshi Kagawa, Yoshinori Nagai, Hiroshi Wako
- H. Fujisaki, Vibrational energy relaxation in proteins, Gordon Research Conference on vibrational spectroscopy, Biddeford, Maine (USA), Aug. 2010.
- H. Fujisaki, M. Shiga, and A. Kidera, Sampling path ensembles using the Onsager-Machlup action with replica exchange：Model Calculations, 54th Annual Meeting of Biophysical Society, San Francisco (USA), Feb. 2010．
- H. Fujisaki, M. Shiga, and A. Kidera, Onsager-Machlup action-based path sampling and its combination with the replica exchange method, The 3rd International Symposium on Molecular Theory for Real Systems (Kyoto Univ., Japan), Jan. 2010．
- H. Fujisaki, H. Kikuchi, T. Furuta, K. Okamoto, T. Nishino, Significance of enzyme fluctuation in the lock-key mechanism between xanthine oxidoreductase and Febuxostat．The 3rd International Symposium on Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions (Nagoya Univ., Japan) Dec. 2009．
■国内会議(2009~2012)
- 藤崎弘士，菊地浩人，戸田幹人，高見利也，「分子階層モデルを使った量子ダイナミクスII 」，日本物理学会 春季大会、2012年3月
- 志賀基之，藤崎弘士，「量子統計に従ったプロトン移動反応の経路探索」，日本物理学会 春季大会、2012年3月
- 下川倫子，高見利也，藤崎弘士，小林泰三，「粘性流体中を落下する滴の分離と変形」，日本物理学会 春季大会、2012年3月
- 戸田幹人，高見利也，福水健次，菊地浩人，藤崎弘士，「生体分子の分子動力学時系列データに対する統計解析2」，日本物理学会 春季大会、2012年3月
- 冨士香奈，関嶋政和，藤崎弘士，戸田幹人，「生体分子の分子動力学に対する時系列解析−集団運動の揺らぎと構造変化の関係を探る−」，日本物理学会 春季大会、2012年3月
- 高見利也，藤崎弘士，「カオス系の最適制御問題における量子古典対応2」，日本物理学会 春季大会、2012年3月
- 松永康佑，藤崎弘士，寺田透，木寺詔紀，「タンパク質構造変化における最小自由エネルギー経路の解析」, 第 25 回分子シミュレーション討論会, 東京工業大学 大岡山キャンパス, 2011 年12月
- 藤崎弘士，菊地浩人，戸田幹人，高見利也、「分子階層モデルを使った生体分子の量子ダイナミクス」日本物理学会 秋季大会、2011年9月
- 戸田幹人，高見利也，福水健次，菊地浩人，藤崎弘士，「生体分子の分子動力学時系列データに対する統計解析」日本物理学会 秋季大会、2011年9月
- 高見利也，下川倫子，藤崎弘士，小林泰三「遅いダイナミクスにより生成される表面パターン」日本物理学会 秋季大会、2011年9月
- 高見利也，藤崎弘士、「カオス系の最適制御問題における量子古典対応」日本物理学会 秋季大会、2011年9月
- 菊地浩人，藤崎弘士，古田忠臣，岡本研，西野武士、「キサンチン酸化還元酵素に対するフェブキソスタットの阻害作用」日本物理学会 秋季大会、2011年9月
- 香川浩、藤崎弘士、菊地浩人、志賀基之，「ミオシンATPase における加水分解の反応経路:QM/MM 法による計算」日本物理学会 秋季大会、2011年9月
- 香川浩，藤崎弘士，菊地浩人，志賀基之，ミオシンATPase の分子軌道法による研究：ストリング法による加水分解反応経路の計算，日本物理学会（第66 回）（新潟），2011年3月．
- 藤崎弘士，菊地浩人，戸田幹人，生体分子の量子エネルギー移動ダイナミクス．日本物理学会（第66 回）（新潟），2011年3月
- 菊地浩人，藤崎弘士，古田忠臣，岡本研，S. Leimkuhler，西野武士, キサンチン酸化還元酵素における阻害剤の作用の研究：「鍵と鍵穴」のドグマを超えて．日本物理学会（第66 回）（新潟），2011年3月
- 高見利也，藤崎弘士, 多準位量子状態の最適制御と半古典極限．日本物理学会（第66 回）（新潟），2011年3月
- 志賀 基之、藤崎弘士、「水素・重水素移動反応の量子統計力学的第一原理計算」, 次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発第５回公開シンポジウム、神戸 2011 年2 月
- 藤崎弘士，志賀基之，木寺詔紀, A multi-scale approach for path sampling, バイオスーパーコンピューティングシンポジウム（第3 回）（神戸），2011年2月
- 松永康佑，藤崎弘士，寺田透，古田忠臣，木寺詔紀, ストリング法によるタンパク質構造変化サンプリング，バイオスーパーコンピューティングシンポジウム （第3 回）（神戸），2011年2月
- 藤崎弘士，菊地浩人，戸田幹人，J.E. Straub, Quantum dynamics study of energy transfer phenomena in porphyrinand its classical analysis．日本物理学会秋季大会（大阪），2010年9月
- 志賀基之，藤崎弘士, 水素・重水素移動反応の量子統計力学的第一原理計算．分子科学討論会（大阪），2010年9月
- 香川浩，菊地浩人，藤崎弘士，永井喜則，輪湖浩, Molecular Orbital Analysis to Investigate the Reaction Mechanism of ATP Hydrolysis in Myosin Motor Domain．日本生物物理学会（第48 回）（仙台），2010年9月
- 藤崎弘士，志賀基之，木寺詔紀, Path sampling for a model polymer using the Onsager-Machlup action．日本生物物理学会（第48 回）（仙台），2010年9月
- 2010/09/21 日本生物物理学会第48回年会 (仙台)
Molecular Orbital Analysis to Investigate the Reaction Mechanism of ATP Hydrolysis in Myosin Motor Domain
Hiroshi Kagawa, Hiroto Kikuchi, Hiroshi Fujisaki, Yoshinori Nagai, Hiroshi Wako
- 菊地浩人，藤崎弘士，古田忠臣，岡本 研，S. Leimkuler，西野武士, Molecular dynamics study of the interaction between xanthine oxidoreductase and the inhibitor, 日本生物物理学会（第48 回）（仙台），2010年9月
- 松永康佑，藤崎弘士，木寺詔紀, Capturing large-scale conformational transitions of adenylate kinase using the string method．日本生物物理学会（第48 回）（仙台），2010年9月
- 志賀基之，藤崎弘士, 水素・重水素移動反応の量子統計力学的第一原理計算, 理論化学討論会（札幌），2010年5月
- 藤崎弘士，志賀基之，木寺詔紀, Sampling path ensembles using the Onsager-Machlup action with replica exchange: Model Calculations, バイオスーパーコンピューティングシンポジウム（第2 回）（東京），2010年3月
- 高見利也，藤崎弘士，量子状態制御問題とカオス，古典および量子ダイナミクス・非平衡統計力学に関するワークショップ（東大弥生講堂, 東京），2010年2月
- 藤崎弘士，志賀基之，木寺詔紀, Onsager-Machlup action-based path sampling and its combination with the replica exchange method．Workshop on dynamical systems theory and reaction（京都），2010年1月
- 2009/12/25 森和英記念計算科学研究会 (東京)
分子軌道の大域的性質と局所的性質の関係
永井 喜則，香川 浩
- 菊地浩人，藤崎弘士，古田忠臣，岡本研，S. Leimkuler，西野武士, Significance of enzyme fluctuation in the lock-key mechanism between xanthine oxidoreductase and Febuxostat．日本生物物理学会年会（第47 回）（徳島），2009年11月
- 藤崎弘士，志賀基之，木寺詔紀, Transition path sampling using the Onsager-Machlup action with replica exchange: Model calculations．日本生物物理学会年会（第47 回）（徳島），2009年11月
- 2009/11/01 日本生物物理学会第47回年会 (徳島)
Relative Changes of Distances between Each Pair of Amino Acid Residues in Myosin Motor Domain during ATP Hydrolysis
Hiroshi Kagawa, Yoshinori Nagai, Hiroshi Wako
- 松永康佑，藤崎弘士，木寺詔紀, パスサンプリングによるタンパク質構造変化解析．次世代スーパーコンピューティング・シンポジウム2009（東京），2009年10月
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